Diversos métodos compuestos de alto nivel en química cuántica, tales como las teorías Gaussian-n y Weizmann-n, han sido empleados para estimar las entalpías de formación de contaminantes atmosféricos peroxídicos a partir de energías de atomización totales y de esquemas de reacciones isodésmicas. Los valores estimados para la ΔHºf,298K de HOOH, HOOF, HOOCl, HOONO, FOOF, FOOCl, FOONO, ClOOCl y ClOONO son −32,2 ± 0,8; −10,9 ± 1,1; −8,4x10 − 2 ± 1,2; −2,9 ± 0,7; 8,4 ± 1,6; 21,5 ± 1,3; 19,7 ± 1,3; 32,3 ± 1,4y −31,3 ± 0,8 kcal mol−1, respectivamente. Una comparación entre los valores experimentales existentes y los valores teóricos obtenidos es presentada en este trabajo, destacando la alta precisión química con un bajo costo computacional.

Different high-level quantum chemical composite methods such as the Gaussian-n and Weizmann-n theories have been used to derive enthalpy of formation values from calculated atomization energies and scheme isodesmic reactions of peroxide pollutants. The resulting values of ΔHºf,298K de HOOH, HOOF, HOOCl, HOONO, FOOF, FOOCl, FOONO, ClOOCl y ClOONO son −32,2 ± 0,8; −10,9 ± 1,1; −8,4x10 − 2 ± 1,2; −2,9 ± 0,7; 8,4 ± 1,6; 21,5 ± 1,3; 19,7 ± 1,3; 32,3 ± 1,4 and −31,3 ± 0,8 kcal mol−1, respectively. A comparison with previous experimental and theoretical values are presented highlighting the high chemical accuracy with low computational cost.

Se realizaron una serie de cálculos teóricos aplicados a una reacción de Diels-Alder, en los que se usaron una serie de plantillas de antraceno quiral y unos dienófilos derivados del anhidro maleico y maleimidas. Los cálculos fueron hechos con la ayuda del programa Gaussian 98, usando la funcional B3LYP junto con la base de cálculo 3-21G*. Con estos resultados fue posible analizar esta serie de compuestos, calculando su estabilidad energética y geometría, además de analizar el impacto que tienen sobre su reactividad los orbitales frontera HOMO y LUMO cuando los sustituyentes varían para una serie de plantillas y dienófilos. La energía de los orbitales frontera fue analizada y se pudo concluir que la reacción estudiada era del tipo de Diels-Alder de demanda normal de electrones y que los sustituyentes son importantes en el aumento de la reactividad de la reacción, encontrándose que el dieno, en este caso la plantilla de antraceno, hace aumentar la energía de los orbitales frontera cuando se encuentra unida a un sustituyente donante de electrones, y en cuanto a los dienófilos, se encontró que cuando se encuentran unidos a un sustituyente atractor de electrones, esto trae como consecuencia que se disminuya la energía de los orbitales frontera HOMO y LUMO. Respecto a la geometría de los orbitales frontera, se encontró que brinda información acerca de la estéreo selectividad de la reacción, en donde el principio de conservación de la simetría orbital es el que rige la orientación de los sustituyentes en la reacción, en la cual se concluyó que para dienófilos sustituidos se observó que estos quedan orientados en la cara opuesta del centro estereogénico de la plantilla para este tipo de moléculas.

A theoretical calculation' series was applied to a reaction of Diels-Alder, in which some series of quiral anthracene groups and dienofilos derived from the maleic anhydride and maleimides were used. The calculations were carried out in the program Gaussian 98 using the functional B3LYP along with the base 3-21G*. The energy of the frontier orbitals was analyzed, and it was possible to conclude that the reaction was the type Diels-Alder of normal demand of electrons, which is useful to increase the reactivity when a diene is bonded to a substituent donator of electrons, because in this way the energy of orbitals HOMO-LUMO increases, and when the dienofiles were bonded to a substituent that attracts electrons, the energy of the orbitals HOMO-LUMO decreases. With respect to the orbital geometry of the frontier orbitals was found that stereo selectivity in the reaction was a guide under the conservation principle of the orbital symmetry.

Background: Crystallization is not always achieved for all proteins in a good size and a good quality for X-ray diffraction. So that condition opens a field for the development of theoretical molecular and protein studies allowing the representation of the molecules in 3D, providing spatial information to study the interaction between ligands and macromolecular receptors. Materials and Methods: In silico study from primary sequence analysis of six different proteins LuxS crystallized of several bacteria. 1J6X protein of Helicobacter pylori was selected for its similarity with the LuxS protein sequence in Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis) strain W83 to produce a homology model of this protein, using the Sybyl and MOE software. A docking was performed to assess the reproducibility of the model in a biological environment. Results: The LuxS protein modelling of P. gingivalis strain W83 was developed, which allows the approach to a proposed structure for the interaction between the protein and its natural ligand. The model generated with computational resources achieved the correct position and biological behavior by means of developed calculations. The docking showed a cavity in which the ligand adopted several positions with good results. Conclusions: A LuxS protein model was obtained, validated by different methods. This generated a 3D model for LuxS protein in P. gingivalis strain W83 with biological reproducibility by means of molecular docking.

Antecedentes: En las proteínas no se logra siempre su cristalización, de buen tamaño y de buena calidad para someterla a difracción de rayos X. De tal manera que se abre un campo para el desarrollo de estudios teóricos moleculares y proteínicos, que permiten la representación de las moléculas en tres dimensiones, proporcionando una información espacial para estudiar la interacción entre ligandos y receptores macromoleculares. Materialesy Métodos: Estudio In silico, a partir del análisis de secuencias primarias de seis diferentes proteínas LuxS cristalizadas de diversas bacterias, se seleccionó la proteína 1J6X del Helicobacter pylori, por su similaridad con la secuencia de la proteína LuxS en Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis) cepa W83, para producir un modelo por homología de esta proteína, utilizando los programas Sybyl y MOE. Se realizó un acoplamiento con el ligando natural para evaluar la reproducibilidad del modelo en un ambiente biológico. Resultados: Se desarrolló el modelado de la proteína LuxS de P. gingivalis cepa W83, que permite el acercamiento a una estructura que se propone, por la interacción entre la proteína y su ligando natural. El modelo generado con recursos computacionales logró una correcta estructura molecular que aceptó la realización de diversos cálculos. El acoplamiento demostró una cavidad donde se logran diversas posiciones del ligando con buenos resultados. Conclusiones: Se obtuvo un modelo 3D para la proteína LuxS en la P. gingivalis cepa W83 validado por diferentes métodos computacionales con una adecuada reproducibilidad biológica por medio del acoplamiento molecular.

In modern periodontics, we must check continuously many concepts that are driving some time, which does not allow the progress and development of many structures of thinking in solving problems such as periodontal disease in all its various forms presentation. The concept of biofilms is in progress so overwhelming that the ability of discussion is completely necessary and indispensable, so that you can update and change a plaque idea to a concept much more complex, dynamic, and that genetic exchange what has been established to date. Biofilms are a non-random, is a form of growth and sustainability quite advanced and structured to facilitate the survival of the pathogens included in these partnerships. This article is a narrative review, mechanisms such as quorum sensing, biofilms and the relationship of these with periodontal diseases that affect many people at all latitudes worldwide. It explores various concepts and research areas with potential application in biomedical experimentation level.

En la periodoncia moderna, el concepto de biopelículas viene en un progreso tan abrumador que la capacidad de discusión se hace necesaria y completamente indispensable, de forma que se pueda actualizar y cambiar de una idea de placa bacteriana a un concepto mucho más complejo, dinámico y de intercambio génico que lo que se viene estableciendo. Las biopelículas muestran una organización no al azar, con una forma de crecimiento y de sostenibilidad muy avanzada y estructurada que facilita la supervivencia de los patógenos incluidos dentro de estas formas de asociación. El presente artículo es una revisión narrativa de los mecanismos de como el quórum sensing y las biopelículas se relacionan con las enfermedades periodontales que afectan a tantas personas en todas las latitudes a nivel mundial. Se exploran diversos conceptos y campos de investigación biomédicas con posibles aplicaciones a nivel experimental.

Quantum Chemical calculations for group 14 elements of Periodic Table (C, Si, Ge, Sn, Pb) and their functional groups have been carried out using Density Functional Theory (DFT) based reactivity descriptors such as group electronegativities, hardness and softness. DFT calculations were performed for a large series of tetracoordinated Sn compounds of the CH3SnRR'X type, where X is a halogen and R and R' are alkyl, halogenated alkyl, alkoxy, or alkyl thio groups. The results were interpreted in terms of calculated electronegativity and hardness of the SnRR'X groups, applying a methodology previously developed by Geerlings and coworkers (J. Phys. Chem. 1993, 97, 1826). These calculations allowed to see the regularities concerning the influence of the nature of organic groups RR' and inorganic group X on electronegativities and hardness of the SnRR'X groups; in this case, it was found a very good correlation between the electronegativity of the fragment and experimental 119Sn chemical shifts, a property that sensitively reflects the change in the valence electronic structure of molecules. This work was complemented with the study of some compounds of the EX and ER types, where E= C, Si, Ge, Sn and R= CH3, H, which was performed to study the influence that the central atom has on the electronegativity and hardness of molecules, or whether these properties are mainly affected for the type of ligand bound to the central atom. All these calculations were performed using the B3PW91 functional together with the 6-311++G** basis set level for H, C, Si, Ge, F, Cl and Br atoms and the 3-21G for Sn and I atoms.